原著論文・総説（査読有）

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• 122. Inagaki A, Sugimoto Y, Allen ML, Koike S () Documentation of an Asiatic black bear preying on a living sika deer caught in a leg-hold snare trap. Ursus
• 121. Sato K, Goto Y, Koike S (2024) Epizoochorous seed dispersal by two Phasianidae birds: Green pheasant (Phasianus versicolor) and Chinese bamboo partridge (Bambusicola thoracicus). Ecological Research
• 120. Takekoshi N, Fujitani A, Ohnishi N, Kozakai C, Koike S, Yamazaki K (2024) Factors affecting body weight fluctuation in free-ranging Asian black bears. Ursus
• 119. Maeda N, Baek S, Tochigi K, Naganuma T, Koike S (2024) Feeding habits of Japanese serow in a warm-temperate, low-elevation, evergreen broad-leaved shrub-dominated forest. Mammal Study 49: 273-287.
• 118. Kazama K, Fujita K, Shinoda Y, Koike S (2024) Sika deer trajectory prediction considering environmental factors by timeseries transformer-based architecture. Expert Systems with Applications 250: 123630. ⇒
• ＞プレスリリース「周辺の環境情報を適切に考慮したニホンジカの移動経路予測を行うAI技術を開発」
  
• 117. Taniwaki T, Tamura A, Sashimura N, Naruse M, Tochigi K, Komine H, Koike S (2024) Indirect effects of low-impact thinning on insect communities in forest floor of coniferous plantations. Journal of Forest Research 29: 316-325.
• 116. Yasuda K, Taniwaki T, Amano T, Koike S (2024) Responses of a bird community to sporadic outbreaks of woody herbivorous insects in a temperate beech forest in Japan. Forest Ecology and Management 560: 121824.⇒
• ＞プレスリリース「繁殖期の鳥は大発生する昆虫の天敵になりうるか？ ?ハバチの大発生に同調する鳥類を特定?」
  
• 115. Dawson BM, Evans MJ, Barton PS, Soga M, Tochigi K, Koike S (2024) Drastic changes in ground-dwelling beetle communities following high-intensity deer culling: Insights from an island ecosystem. Environmental Entomology 53: 223-229.⇒
• 114. Inagaki A, Allen M, Maruyama T, Tochigi K, Koike S (2023) Evidence for interspecific modulation of carcass consumption among facultative scavengers in Asian temperate forest. Food Webs 37: e00324
• 113. Baek S, Shimazaki A, Zedrosser A, Naganuma T, Kozakai C, Yamazaki K, Koike S (2023) Response to human-modified landscape of an apex consumer: Sex- and season-related variations in road selection and movement pattern. Global Ecology and Conservation 46: e02603.⇒
• 112.Tochigi K, Steyaert S, Fukasawa K, Kuroe M, Anezaki T, Naganuma T, Kozakai C, Inagaki A, Yamazaki K, Koike S (2023) Demographic parameters of Asian black bears in central Japan. Mammal Study 48: 231-144.⇒
• ＞プレスリリース「メスの野生ツキノワグマの一生を探る ～個体群レベルの繁殖と死亡を定量的に評価～」
  ＞TECH+での紹介
• 111.Sato K, Goto Y, Koike S (2023) Seed attachment by epizoochory depends on animal fur, body height, and plant phenology. Acta Oecologia 119: 103914.
• ＞プレスリリース「ひっつき虫は誰が運ぶ？～動物に付着する種子の量に影響する要因の解明～」
  ＞ナゾロジーでの紹介
  ＞TECH+での紹介
  ＞大学ジャーナルでの紹介
• 110.Tanaka M, Baek S, Tochigi K, Naganuma T, Inagaki A, Dewi BS, Koike S (2023) Conditions affecting ant nesting in stumps in a temperate coniferous planted forest. Forest Ecology and Management 537: 120976.
• 109.Hiruma M, Takada H, Washida A, Koike S (2023) Dietary partitioning and competition between sika deer and Japanese serows in high elevation habitats. Mammal Research 68: 305-315.
• ＞プレスリリース「シカとカモシカの食物の分けあいと取りあい競争～生息環境によって変わる種間関係～」
  
• 108.Osugi S, Baek S, Naganuma T, Tochigi K, Allen M, Koike S (2022) The effect of decreasing human activity from COVID-19 on the foraging of fallen-fruit by omnivores. Ecology and Evolution 12: e9657. ⇒
• ＞プレスリリース「タヌキ・アナグマの食事スタイルは人間活動の影響を受けていた？～COVID-19がもたらした都市の野生動物の行動変化～」
  ＞ナゾロジーでの紹介
  ＞大学ジャーナルでの紹介
• 107.Takayama K, Ohnishi N, Zedrosser A, Anezaki T, Tochigi K, Inagaki A,　Naganauma T, Yamazaki K, Koike S (2023) Timing and distance of natal dispersal in Asian black bears. Journal of Mammalogy 104: 265-278.⇒
• ＞プレスリリース「ツキノワグマの独り立ち～子グマが出生地を離れる時期と距離を解明～」
  
• 106.Tochigi K, Steyaert S, Naganuma T, Yamazaki K, Koike S (2022) Differentiation and seasonality in suitable microsites of seed dispersal by an assemblage of omnivorous mammals. Global Ecology and Conservation 40: e02335.⇒
• ＞プレスリリース「果実を食べる哺乳類はどこにタネを運んでいる？～季節によって変わる種子の運び手の役割～」
  
• 105.Tezuka S, Tanaka M, Naganuma T, Tochigi K, Inagaki A, Myojo H, Yamazaki K, Allen M, Koike S (2023) Comparing information derived on food habits of a terrestrial carnivore between animal-borne video systems and fecal analyses methods. Journal of Mammalogy 104: 184-193.⇒
• ＞プレスリリース「クマ目線でとらえたクマの食生活～首輪に内蔵したカメラでツキノワグマの食生活を撮影～ 」
  ＞ナゾロジーでの紹介
  ＞大学ジャーナルでの紹介
• 104.Inagaki A, Allen M, Maruyama T, Yamazaki K, Tochigi K, Naganuma T, Koike S (2022) Carcass detection and consumption by facultative scavengers in forest ecosystem highlights the value of their ecosystem services. Scientific Reports 12: 16451.⇒
• ＞プレスリリース「森の中のシカ死体、だれが最初に見つけて食べている？～動物によるシカ死体の発見と消失のパターンを解明～」
  ＞ナゾロジーでの紹介
  ＞大学ジャーナルでの紹介
• 103.Koike S, Tochigi K, Yamazaki K (2023) Are seeds of trees with higher fruit production dispersed farther by frugivorous mammals? Journal of Forest Research 28: 64-72.⇒
• ＞プレスリリース「実りの豊かな木ほど遠くまでタネを散布する～哺乳類の種子散布者としての役割を定量的に評価～」
• 102.Hiruma M, Tochigi K, Kishimoto R, Kuroe M, Trentin EB, Koike S (2022) Long-term stability in the winter diet of the Japanese serow. Zookeys 1122: 39-51.⇒
• 101.Oki K, Soga M, Amano T, Koike S (2022) Abandonment of ski pistes impoverishes butterfly communities. Biodiversity and Conservation 31: 2083-2096.
• ＞プレスリリース「スキー場であり続けることがチョウにとっては大切～ゲレンデの閉鎖はチョウ類相を衰退させることを発見～」
• 100. Ando K, Yoshikawa T, Kozakai C, Yamazaki K, Naganuma T, Inagaki A, Koike S (2022) Composite brownian walks best explain the movement patterns of Asian black bears, irrespective of sex, seasonality and food availability. Ecological Research 37: 522-531.
• 99. Naganuma T, Nakashita R, Tochigi K, Zedrosser A, Kozakai C, Yamazaki K, Koike S (2022) Functional dietary response of Asian black bears to changes in sika deer density. Journal of Wildlife Management 86: e22218.
• ＞プレスリリース「シカの増減でクマの食生活はどう変わる？～個体で異なるツキノワグマのお食事変遷～ 」
  ＞TECH+での紹介
• 98. Allen M, Krofel M, Yamazaki K, Alexander EP, Koike S (2022) Cannibalism in bears. Ursus 33: e10.
• 97. Osugi S, Trenti EB, Koike S (2022) Effects of human activity on the fallen-fruit foraging behavior of Carnivora in an urban forest. Mammal Study 47: 113-123.
• ＞プレスリリース「人を避けてこっそり、すばやくお食事？～タヌキとアナグマの都市適応術～」
  ＞ナゾロジーでの紹介
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• 96.Taniwaki T, Watanabe K, Komine H, Tochigi K, Yamane M, Koike S (2022) Response of specialist and generalist predators to nonprogressive annual fluctuations in herbivorous insect population. Biological Control 165: 104810.
• ＞プレスリリース「大発生のタイミングはお見通し？～ハバチの不規則な発生に同調する寄生バチを発見～」
• 95.Oki K, Soga M, Amano T, Koike S (2021) Power-line corridors in conifer plantations as novel habitat for butterflies. Journal of Insect Conservation 25:829-840.
• ＞プレスリリース「送電線下に広がるチョウの楽園～送電線はチョウの保全に貢献することを発見～」
  ＞サイエンスポータルでの紹介
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• 94.Baek S, Iwasaki T, Yamazaki K, Naganuma T, Inagaki A, Tochigi K, Allen ML, Kozakai C, Koike S (2021) Factors affecting predenning activity in Asian black bears. Mammal Study 46: 341-346.
• 93. Sebastian-Gonzalez E, Morales-Reyes Z, Botella F, Naves-Alegre L, Perez-Garcia JM, Mateo-Tomas P, Olea PP, Moleon M, Barbosa JM, Hiraldo F, Arrondo E, Donazar JA, Cortes-Avizanda A, Selva N, Lambertucci SA, Bhattacharjee A, Brewer AL, Abernethy EF, Turner KL, Beasley JC, DeVault TL, Gerke HC, Rhodes OE, Ordiz A, Wikenros C, Zimmermann B, Wabakken P, Wilmers CC, Smith JA, Kendall CJ, Ogada D, Frehner E, Allen ML, Wittmer HU, Butler JRA, du Toit JT, Margalida A, Oliva-Vidal P, Wilson D, Jerina K, Krofel M, Kostecke R, Inger R, Per E, Ayhan Y, Sanci M, Yilmazer U, Inagaki A, Koike S, Samson A, Perrig PL, Spencer E, Newsome TM, Heurich M, Anadon JD, Buechley ER, Gutierrez-Canovas C, Elbroch LM, Sanchez-Zapata JA (2021) Functional traits driving species role in the structure of terrestrial vertebrate scavenger networks. Ecology102:e03519.⇒
• 92. Naganuma T, Tanaka M, Teduka S, Steyaert S, Tochigi K, Inagaki A, Myojo H, Yamazaki K, Koike S (2021) Animal-borne video systems provide insight into the reproductive behavior of the Asian black bear. Ecology and Evolution 11:9181-9190.⇒
• ＞プレスリリース「知られざるクマたちの恋愛事情～ツキノワグマの繁殖行動の撮影に初めて成功～ 」
• 91. Tomiyasu T, Kayano M, Hazano K, Matsui M, Nemoto Y, Naganuma T, Koike K, Yamazaki K (2021) Associations between plasma testosterone levels and season, nutritional status, age, and body size in free-ranging male Asian black bears (Ursus thibetanus) in central Honshu, Japan. General and Comparative Endocrinology 309: 113794.
• 90. Ogawa Y, Tochigi K, Naganuma T, Dewi B S, Koike S (2021) Marking behavior of Asiatic black bears (Ursus thibetanus) at rub trees. Ursus : .
• 89. Tochigi K, Kato S, Kikuchi S, Naoe S, Koike S, Nagamitsu T (2021) Phenological shift along an elevational gradient and dispersal of pollen and seeds maintain a hybrid zone between two cherry tree species. Plant Species Biology 36: 230-245.⇒
• ＞森林総研チャンネル（動画）での紹介
• 88. Maekawa T, Ohara K, Zhang Y, Fukutomi M, Matsumoto S, Matsumura K, Shidara H, Yamazaki S, Fujisawa R, Ide K, Nagaya N, Yamazaki K, Koike S, Miyatake T, Kimura K, Ogawa H, Takahashi S, Yoda K (2020) Deep learning-assisted comparative analysis of animal trajectories with DeepHL. Nature Communications 11: 5316.⇒
• 87. Moustafa MAM, Sasaki A, Shimozuru M, Nakao R, Sashika M, Yamazaki K, Koike S, Tanaka J, Tamatani H, Tsubota T (2020) Molecular detection of apicomplexan protozoa in Hokkaido brown bears (Ursus arctos yesoensis) and Japanese black bears (Ursus thibetanus japonicus). Parasitology Research 119: 3739-3753.
• 86. Allen M, Wittmer H, Ingaki A, Yamazaki K, Koike S (2021) Food caching by bears: a literature review and new observations for Asiatic and American black bears. Ursus 32:e10.
• 85. Osugi S, Trenti EB, Koike S (2020) What determines the seedling viability of different tree species in raccoon dog latrines?. Acta Oecologica 106: 103604.
• 84. Sebastian-Gonzalez E, Morales-Reyes Z, Botella F, Naves-Alegre L, Perez-Garcia JM, Mateo-Tomas P, Olea PP, Moleon M, Barbosa JM, Hiraldo F, Arrondo E, Donazar JA, Cortes-Avizanda A, Selva N, Lambertucci SA, Bhattacharjee A, Brewer A, Abernethy E, Turner T, Beasley JC, DeVault TL, Gerke HC, Rhodes Jr OE, Ordiz A, Wikenros C, Zimmermann B, Wabakken P, Wilmers CC, Smith JA, Kendall CJ, Ogada D, Frehner E, Allen ML, Wittmer HU, Butler JRA, du Toit JT, Read J, Margalida A, Oliva-Vidal P, Wilson D, Jerina K, Krofel M, Kostecke R, Inger R, Per E, Ayhan Y, Ulusoy H, Vural D, Inagaki A, Koike S, Samson A, Perrig PL, Spencer E, Newsome TM, Heurich M, Anadon JD, Buechley ER, Sanchez-Zapata JA (2020) Network structure of vertebrate scavenger assemblages at the global scale: drivers and ecosystem functioning implications. Ecography43: 1143-1155.⇒
• 83. Masaki T, Abe S, Naoe S, Koike S, Nakajima A, Nemoto Y, Yamazaki K (2020) Horizontal and elevational patterns of masting across multiple species in a steep montane landscape from the perspective of forest mammal management. Journal of Forest Research 25: 92-100.⇒
• 82. Komine H, Koike S, Schwarzkopf L (2020) Impacts of artificial light on food intake in invasive toads. Scientific Reports 10: 6527.⇒
• ＞プレスリリース「 光と月と外来種？！～人工光による外来カエルへの影響は月の満ち欠けに影響される～ 」
  ＞大学ジャーナルでの紹介
• 81. Ogawa Y, Tochigi K, Naganuma T, Dewi B S, Koike S (2020) Tree rubbing by Asian black bears (Ursus thibetanus) in conifer plantations in Okutama Mountain in Japan. Animal Biology 70: 351-358.
• 80. Komine H, Trentin EB, Koike S (2020) Relative abundance differences of two invasive toad species in Minami-daito and Kita- daito Islands Japan. Current Herpetology 39: 38-468.
• 79. Inagaki A, Allen M, Maruyama T, Yamazaki K, Tochigi K, Naganuma T, Koike S (2020) Vertebrate scavenger guild composition and utilization of carrion in an East Asian temperate forest. Ecology and Evolution 10: 1223-1232.⇒
• ＞プレスリリース「 森の掃除屋さん～シカの死体に群がる動物たち～ 」
  ＞大学ジャーナルでの紹介
• 78. Naganuma T, Koike S, Nakashita R, Kozakai C, Yamazaki K, Furusaka S, Kaji K (2020) Age- and sex-associated differences in the diet of the Asian black bear: importance of hard mast and sika deer. Mammal Study 45: 155-166.⇒
• ＞プレスリリース「クマそれぞれのお食事メニュー～性別と年齢で変わる食生活～」
  ＞サイエンスポータルでの紹介
• 77. Yama H, Naganuma T, Tochigi K, Trentin EB, Nakashita R, Inagaki A, Koike S (2019) Increasing sika deer population density may change resource use by larval dung beetles. PloS One 14: e0226078.⇒
• 76. Naoe S, Tayasu I, Sakai Y, Masaki T, Kobayashi K, Nakajima A, Sato Y, Yamazaki K, Kiyokawa H, Koike S (2019) Downhill seed dispersal by temperate mammals: a potential threat to plant escape from global warming. Scientific Reports 9: 14932.⇒
• ＞プレスリリース「クマたちの種まきは、温暖化からサルナシが避難することを妨げる」
• 75. Furusaka S, Tochigi K, Yamazaki K, Naganuma T, Inagaki A, Koike S (2019) Estimating the seasonal energy balance in Asian black bears and associated factors. Ecosphere 10: e02891.⇒
• ＞プレスリリース「秋のドングリがクマの一年を支える～エネルギー収支から見たツキノワグマの食いだめ戦略～」
  ＞大学ジャーナルでの紹介
• 74. Nagamitsu T, Kato S, Kikuchi S, Koike S, Naoe S, Masaki T (2019) Multi-scale spatial genetic structure within and between populations of wild cherry trees in nuclear genotypes and chloroplast haplotypes. Ecology and Evolution 9: 11266-11276.⇒
• 73. Osugi S, Trenti EB, Koike S (2019) Impact of wild boars on the feeding behaviors of smaller frugivorous mammals. Mammalian Biology 97: 22-27.
• 72. Yama H, Evans M, Iida T, Soga M, Koike S (2019) The morphological changes of moths on Nakajima Island, Hokkaido, Japan. Environmental Entomology 48: 291-298.
• 71. Kobashikawa S, Trenti B, Koike S (2019) The benefit of wrapping trees in biodegradable material netting to protect against bark stripping by bears extends to surrounding stands. Forest Ecology and Management 437: 134-138.
• 70. Fuchs B, Yamazaki K, Evans A, Tsubota T, Koike S, Naganuma T, Arnemo J (2019) Heart rate during hyperphagia differs between two bear species. Biology letters 15(1): 20180681.
• 69. Tochigi K, Aoki Y, Maruyama T, Yamazaki K, Kozakai C, Naganuma T, Inagaki A, Masaki T, Koike S (2019) Does hard mast production affect patterns of cementum annuli formation in premolar teeth of Asian black bears (Ursus thibetanus)?. PLoS ONE 14: e0211561.⇒
• 68. Koike S, Masaki T (2019) Characteristics of fruits consumed by mammalian frugivores in Japanese temperate forest. Ecological Research 34: 246-254.
• 67. Tochigi K, Tamatani H, Kozakai C, Inagaki A, Naganuma T, Myojo H, Yamazaki K, Koike S (2018) Reproductive histories of Asian black bears can be determined by cementum annuli widths. Mammal Study 43: 261-268.
• ＞プレスリリース「クマも子育ては大仕事～歯が語る出産・育児の履歴～」
• 66. 根本　唯・小坂井千夏・山﨑晃司・小池伸介・正木　隆・梶　光一（2018）ツキノワグマの秋期における堅果樹種および人為景観に対する選択の個体差と性差．哺乳類科学 57: 205-219.⇒
• 65. Nakajima A, Koike S, Yamazaki K, Kozakai C, Nemoto Y, Masaki T, Kaji K (2018) Feeding habits of Asian black bears (Ursus thibetanus) in relation to the abundance and timing of fruiting in 13 tree species. Mammal Study 43: 167-178.
• 64. Enari H, Koike S, Enari H, Seki Y, Okuda K, Kodera Y (2018) Early-stage ecological influences of population recovery of large mammals on dung beetle assemblages in heavy snow areas. Acta Oecologia 92: 7-15
• 63. Umemura Y, Koike S, Kozakai C, Yamazaki K, Nemoto Y, Nakajima A, Kohri M, Abe S, Masaki T, Kaji K (2018) Using a novel method of potential available energy to determine masting condition influence on sex-specific habitat selection by Asiatic black bears. Mammalia 82: 288-297.
• 62.Tochigi K, Masaki T, Nakajima A, Yamazaki K, Inagaki A, Koike S (2018) Detection of arboreal feeding signs by Asiatic black bears: effects of hard mast production at individual tree and regional scales. Journal of Zoology 305: 223-231.
• ＞プレスリリース「ツキノワグマは木を見て森も見ていた～ クマが木に登ってドングリを食べる条件 ～」
  ＞サイエンスポータルでの紹介
• 61. Iida T, Soga M, Koike S (2018) Large herbivores affect forest ecosystem functions by altering the structure of dung beetle communities. Acta Oecologica 88: 65-70.
• 60. Kato D, Koike S (2018) Estimation of dispersal effectiveness of a variety of avian species in a Japanese temperate forest. Ornithological Science 17: 173-185.
• 59. Kozakai C, Koike S, Ohnishi N, Yamazaki K (2017) Influence of food availability on matrilineal site fidelity of female Asian black bears. Mammal Study 42: 219-230.
• 58. Furusaka S, Kozakai C, Nemoto Y, Umemura Y, Naganuma T, Yamazaki K, Koike S (2017) The selection by the Asiatic black bear of spring plant food items according to their nutritional values. ZooKeys 672: 1211-133.⇒
• 57. Yoshikawa T, Harasawa S, Isagi Y, Niikura N, Koike S, Taki H, Naoe S, Masaki T (2017) Relative importance of landscape features, stand structural attributes, and fruit availability on fruit-eating birds in Japanese forests fragmented by coniferous plantations. Biological Conservation 209: 356-365.
• 56. 根本唯・小坂井千夏・山﨑晃司・小池伸介・中島亜美・郡麻里・正木隆・梶光一（2016）ブナ科堅果結実量の年次変動にともなうツキノワグマの秋期生息地選択の変化．哺乳類科学 56: 105-115.⇒
• 55. Iida T, Soga M, Koike S (2016) Effects of an increase in population of sika deer on beetle communities in deciduous forests. ZooKeys 625: 67-85.⇒
• 54. Mise Y, Soga M, Yamazaki K, Koike S (2016) Comparing methods of acquiring mammalian endozoochorous seed dispersal distance distributions. Ecological Research 31: 881-889.
• 53. Naoe S, Tayasu I, Masaki T, Koike S (2016) Negative correlation between altitudes and oxygen isotope ratios of seeds: exploring its applicability to assess vertical seed dispersal. Ecology and Evolution 6: 6817-6823.⇒
• 52. Kobashikawa S, Koike S (2016) Spatiotemporal factors affecting bark stripping of conifer trees by Asiatic black bears (Ursus thibetanus) in Japan. Forest Ecology and Management 380: 100-106.
• 51. 有本　勲・小池伸介・岡村　寛・山﨑晃司・梶　光一 (2016) GPSテレメトリーによる測位間隔の違いがスイッチング状態空間モデル解析に与える影響の検討：大型陸上哺乳類の例．哺乳類科学 56: 5-16.⇒
• 50. Maeda K, Koike S, Murao M, Ishigane T, Harasawa S, Masaki T, Soga M, Naganuma T, Sato A (2016) Influence of matrix on the occurrence of terrestrial mammals in planted forest landscapes. Pakistan Journal of Zoology 48: 907-911.⇒
• 49. Iida T, Soga M, Hiura T, Koike S (2016) Life history traits predict insect species responses to large herbivore overabundance: A multitaxonomic approach. Journal of Insect Conservation 20: 295-304.
• 48. Naoe S, Tayasu I, Sakai Y, Masaki T, Kobayashi K, Nakajima A, Sato Y, Yamazaki K, Kiyokawa H, Koike S (2016) Mountain climbing bears save cherry species from global warming by their vertical seed dispersal. Current Biology 26: R315-R316.
• ＞プレスリリース「花咲かクマさん：ツキノワグマは野生のサクラのタネを高い標高へ運んでいた」
  ＞森林総研チャンネル（動画）での紹介
• 47．Enari H, Koike S, Sakamaki H (2016) Ecological implications of mammal feces buried in snow through dung beetle activities. Journal of Forest Research 21: 92-98.
• 46．Fujitsu A, Masaki T, Naoe S, Koike S (2016) Factors that influence quantitative frugivory by avian species in a cool temperature forest. Ornithological Science 15: 75-84.
• 45．Koike S, Nakashita R, Kozakai C, Nakajima A, Nemoto Y, Yamazaki K (2016) Baseline characterization of the diet and stable isotope signatures of bears that consume natural foods in central Japan. European Journal of Wildlife Research 62: 23-31.
• 44．Nakajima A, Masaki T, Koike S, Yamazaki K, Kaji K (2015) Estimation of tree crop size across multiple taxa: Generalization of a visual survey method. Open Journal of Forestry 5: 651-661.⇒
• 43．Doormaal NV, Ohashi H, Koike S, Kaji K (2015) Influence of human activities on the activity patterns of Japanese sika deer (Cervus nippon) and wild boar (Sus scrofa) in central Japan. European Journal of Wildlife Research 61: 517-527.
• 42．Soga M, Yamaura Y, Koike S, Gaston K (2014) Land sharing vs. land sparing: does the compact city reconcile urban development and biodiversity conservation? Journal of Applied Ecology 51: 1378-1386.
• 41．Koike S, Soga M, Nemoto Y, Kozakai C (2014) How are dung beetle species affected by deer population increases in a cool temperate forest ecosystem?. Journal of Zoology 239: 227-233.
• 40．有本勲・岡村寛・小池伸介・山﨑晃司・梶光一（2014）集落周辺に生息するツキノワグマの行動と利用環境．哺乳類科学 54: 19－31.⇒
• 39．Soga M, Yamaura Y, Koike S, Gaston KJ (2014)Woodland remnants as an urban wildlife refuge: a cross-taxonomic assessment. Biodiversity and Conservation 23: 649-659.
• 38．川村芙友美・有本　勲・小池伸介・山﨑晃司・森　貴久（2014）人工林におけるツキノワグマの潜在的な食物資源量に施業方法・林齢・樹種・シカ密度が与える影響 ．日本森林学会誌 96: 3-99.⇒
• 37．角田裕志・大橋春香・齊藤正恵・堀江玲子・野場　啓・小池伸介・星野義延・戸田浩人・梶　光一（2014）栃木県佐野市新合地区および氷室地区におけるイノシシの採餌環境．野生生物と社会. 1: 61-70.⇒
• 36. 今木洋大・小金沢正昭・小池伸介 (2013) 米国ワシントン州におけるクマによる樹皮剥ぎ被害対策と日本における応用の可能性．日本森林学会誌 95：280－290.⇒
• 35．Koike S, Soga M, Enari H, Kozakai C, Nemoto Y (2013) Seasonal changes and altitudinal variation in deer fecal pellet decay. European Journal of Wildlife Research 59: 765-768.
• 34．Soga M, Koike S (2013) Patch isolation only matters for specialist butetrfly species, but patch area affects both specialist and generalist species. Journal of Forest Research 18: 270-278.
• 33．Enari H, Koike S, Sakamaki H (2013) Influences of different large mammal faunas on the dung beetle diversity in beech forests. Journal of Insect Science 13: 54.
• 32．大橋春香・野場啓・齊藤正恵・角田裕志・桑原考史・閻美芳・加藤恵里・小池伸介・星野義延・戸田浩人・梶光一 (2013) 栃木県南西部の耕作放棄地に成立する植物群落とイノシシSus scrofa Linnaeusの生息痕跡の関係．植生学会誌 30: 37-49.⇒
• 31．Koike S, Nakashita R, Naganawa K, Koyama M, Tamura A (2013) Changes in diet of a small, isolated bear population over time. Journal of Mammalogy 94: 361-368.
• 30．Kozakai C, Yamazaki K, Nemoto Y, Nakajima A, Umemura Y, Koike S, Goto Y, Kasai S, Abe S, Masaki T, Kaji K (2013) Fluctuation of daily activity time budgets of Japanese black bears: relationship to sex, reproductive status, and hardmast availability. Journal of Mammalogy 94: 351-360.
• 29．Ohashi H, Saito M, Horie R, Tsunoda H, Noba H, Ishii H, Kuwabara K, Hiroshige Y, Koike S, Hoshino Y, Toda H, Kaji K (2013) Influence of human activity on the activity pattern of the wild boar Sus scrofa. European Journal of Wildlife Research 59: 167-177.
• 28．Soga M, Koike S (2013) Mapping the potential extinction debt of butterflies: implications for conservation priorities in an urban landscape. Animal Conservation 16: 1-11.
• 27．Soga M, Kanno N, Yamaura Y, Koike S (2013) Patch size determines the strength of edge effects on carabid beetle assemblages in urban remnant forests. Journal of Insect Conservation 17: 421-428.
• 26．Fujiwara S, Koike S, Yamazaki K, Kozakai C, Kaji K (2013) Direct observation of bear myrmecophagy: Relationship between bears' feeding habits and ant phenology. Mammalian Biology 78: 34-40.
• 25．Soga M, Koike S (2013) Large forest patches promote breeding success of a terrestrial mammal in urban landscapes. PLoS ONE 8: e51802.⇒
• 24．Sano K, Koike S, Takahashi A, Tokita N, Kozakai C, Furubayashi K (2012) Relationships between Swida controversa fruit phenology and fruit removal behaviors of frugivorous birds. Ornithological Science 11: 121-128.
• 23．Koike S, Morimoto H, Kozakai C, Arimoto I, Soga M, Yamazaki K, Koganezawa M (2012) The role of dung beetles as a secondary seed dispersers after dispersal by frugivore mammals in a temperate deciduous forest. Acta Oecologica 41: 74-81.
• 22．Koike S, Morimoto H, Goto Y, Kozakai C, Yamazaki K (2012) Insectivory by sympatric five carnivores in cool-temperate deciduous forests. Mammal Study 37: 73-83.
• 21．Nakajima A, Koike S, Masaki T, Shimada T, Kozakai C, Nemoto Y, Yamazaki K, Kaji K (2012) Spatial and elevational variation in fruiting phenology of a deciduous oak (Quercus crispula) and its effect on foraging behavior of the Asiatic black bear (Ursus thibetanus). Ecological Research 27: 529-538.
• 20．Koike S, Kozakai C, Nemoto Y, Masaki T, Yamazaki K, Abe S, Nakajima A, Umemura Y, Kaji K (2012) Effect of hard mast production on foraging and sex-specific behavior of the Asiatic black bear (Ursus thibetanus). Mammal Study. 37: 21-28.
• 19．Soga M, Koike S (2012) Relative importance of quantity, quality and isolation of patches for butterfly diversity in fragmented urban forests. Ecological Research 27: 265-271.
• 18．Koike S, Morimoto H, Kozakai C, Arimoto I, Yamazaki K, Iwaoka M, Soga M, Koganezawa M (2012) Seed removal and survival in Asiatic black bear Ursus thibetanus faeces: effect of rodents as secondary seed dispersers. Wildlife Biology 18: 24-34.
• 17．Soga M, Koike S (2012) Life-history traits affect valunerability of butterflies to habitat fragmentation in urban remnant forests. Ecoscience 19: 11-20
• 16．Yamazaki K, Kozakai C. Koike S, Morimoto H, Goto Y, Furubayashi K (2012) Myrmecophagy of Japanese black bear in the grasslands of the Ashio area, Nikko National Park, Japan. Ursus 23: 52-64.
• 15．Masaki T, Takahashi K, Sawa A, Kado T, Naoe S, Koike S, Shibata M (2012) Fleshy fruit characteristics in a temperate deciduous forest of Japan: how unique are they? Journal of Plant Research 125: 103-114.
• 14．Enari H, Koike S, Sakamaki H (2011) Diversity of dung beetle assemblages utilizing Japanese monkey feces in cool-temperate forests: influence of seasonality and forest disturbance. Journal of Forest Research 16: 456-464.
• 13．Kozakai C, Yamazaki K, Nemoto Y, Nakajima A, Koike S, Abe S, Masaki T, Kaji K (2011) Effect of mast production on home range use of Japanese black bears. Journal of Wildlife Management 75: 867-875.
• 12．Koike S, Masaki T, Nemoto Y, Kozakai C, Yamazaki K, Kasai S, Nakajima A, Kaji K (2011) Estimate of the seed shadow created by the Asiatic black bear (Ursus thibetanus) and its characteristics as a seed disperser in Japanese cool-temperate forest. Oikos 120: 280-290.
• 11．桑原考史・大橋春香・齊藤正恵・弘重穣・小池伸介・戸田浩人・梶光一（2010）イノシシによる地域農業被害の実態と対策の方向性－栃木県佐野市K土地改良区の事例－．農業経済研究別冊2010年度日本農業経済学会論文集: 305-312．
• 10．Koike S (2010) Long-term trends in food habits of the Asiatic black bear in the Misaka mountains, Japan. Mammalian Biology 75: 17-28．
• 9．Koike S (2009) Fruiting phenology and its effect on fruit feeding behavior of Asiatic black bears. Mammal Study 34: 47-52．
• 8．Yamazaki K, Kozakai C, Kasai S, Goto Y, Koike S, Furubayashi K (2008) A preliminary evaluation of activity sensing GPS collars for estimating daily activity patterns of Japanese black bear. Ursus 19: 154-161．
• 7．Yamazaki K, Kasai S, Koike S, Goto Y, Kozakai C, Furubayashi K (2008) Evaluation of GPS collar performance by stationary tests and fitting on free-ranging Japanese black bears. Mammal study 33: 131-142．⇒
• 6．Kozakai C, Koike S, Yamazaki K, Furubayashi (2008) Examination of captive Japanese black bear activity using motion sensors. Mammal study 33: 115-119．⇒
• 5．Koike S, Morimoto H, Goto Y, Kozakai C, Yamazaki K (2008) Frugivory of carnivores and seed dispersal of fleshy fruits in cool-temperate deciduous forests. Journal of Forest Research 13: 215-222．
• 4．Koike S and Hazumi T (2008) Notes on Asiatic black bears denning habits in the Misaka Mountains, central Japan. Ursus 19: 80-84．
• 3．Koike S, Kasai S, Yamazaki K, Furubayashi K (2008) Fruit phenology of Prunus jamasakura and the feeding habit of the Asiatic black bear as a seed disperser. Ecological Research 23: 385-392．
• 2．山﨑晃司・林友直・横山幸嗣・細川繁・小藤幸史・木下俊一・小坂井千夏・小池伸介 (2008) 低軌道衛星通信を利用したツキノワグマ位置情報のセミリアルタイム送受信システムの試験．哺乳類科学 48: 237-244．⇒
• 1．小池伸介・正木隆 (2008) 本州以南の食肉目3 種による木本果実利用の文献調査．日本森林学会誌 90：27-36．⇒
• 参考：研究室ができる前
• 04．小池伸介・岩井大輔・佐藤伸彦・高野徹（2007）荒川河川敷におけるミドリシジミ（Neozephyrus japonicus）の生息するハンノキ林の環境条件．野生生物保護11：31-41．⇒
• 03．小池伸介・葛西真輔・後藤優介・山崎晃司・古林賢恒(2006)ニホンツキノワグマの糞に飛来する食糞性コガネムシ．日本森林学会誌88：279-285．⇒
• 02．小池伸介・加藤元樹・森本英人・古林賢恒(2006)冷･暖温帯に位置する丹沢山地のニホンジカの糞に飛来する食糞性コガネムシ．野生生物保護 10：45-60．⇒
• 01．小池伸介・羽澄俊裕・古林賢恒(2003)ニホンツキノワグマ（Ursus thibetanus japonicus）の種子散布者の可能性．野生生物保護 8：19-30．⇒

著書

• 40）小池伸介 (2024) 森の中での関わり合い―食べ物をめぐる種間の関係－．図説日本の森林　森・人・生き物の多様なかかわり．114-115．日本森林学会　編．朝倉出版．東京．
  
• 39）小池伸介（2024）大きなクマが小さなタネを運ぶ．タネまく動物（小池伸介・北村俊平　編著）．10－13．文一総合出版．東京．
  ＞産経新聞の書評での紹介
• 38）小池伸介（2024）いろいろな動物たちが、植物のタネをまいている．タネまく動物（小池伸介・北村俊平　編著）．3－5．文一総合出版．東京．
• 37）小池伸介（2024）トイレにタネをまく．タネまく動物（小池伸介・北村俊平　編著）．22－25．文一総合出版．東京．
• 36）小池伸介（2024）タネまきの最後を締めくくる糞虫．タネまく動物（小池伸介・北村俊平　編著）．116－119．文一総合出版．東京．
• 35）佐藤華音（2024）哺乳類にくっつくタネ．タネまく動物（小池伸介・北村俊平　編著）．54－157．文一総合出版．東京．
• 34）小池伸介・佐藤華音（2024）府中市の希少な動物．新府中市史　自然編．府中市．402-411．
• 33）小池伸介・佐藤華音・小堀原・沖和人・新川颯輝（2024）府中市の動物相．新府中市史　自然編．317-401．
• 33）小池伸介 (2023) ある日、森の中でクマさんのウンコに出会ったら　ツキノワグマ研究者のウンコ採集フン闘記. 辰己出版.　東京．
  ＞日本経済新聞の書評での紹介
• 32）Koike S, Tochigi K, Soga M (2022) Impacts of Sika Deer Overabundance on the Structure and Functions of Dung Beetle Communities in Forest Ecosystems. Sika Deer: Life History Plasticity and Management 387-398. Springer.
• 31）Inagaki A, Allen M, Naganuma T, Koike S (2022) Vertebrate Scavenging on Sika Deer Carcasses and Its Effects on Ecological Processes. Sika Deer: Life History Plasticity and Management 375-385. Springer.
• 30）小池伸介（2022）哺乳類学とはなにか．「哺乳類学　小池伸介・佐藤淳・佐々木基樹・江成広斗　著」1-8.東京大学出版会．東京．
• 29）小池伸介（2022）生態．「哺乳類学　小池伸介・佐藤淳・佐々木基樹・江成広斗　著」203-285.東京大学出版会．東京．
• 28) Fujinami K, Naganuma T, Shinoda Y, Yamazak K, Koike S (2022) Attempts Toward Behavior Recognition of the Asian Black Bears Using an Accelerometer. Sensor- and Video-Based Activity and Behavior Computing 57-79, springer.
• 27）小池伸介（2021）大型哺乳類の保全と管理．「森林・林業実務必携　東京農工大学農学部森林林業実務必携編集委員会　編」104-112.朝倉出版．東京．
• 26）小池伸介（2021）森林の鳥獣害．「森林・林業実務必携　東京農工大学農学部森林林業実務必携編集委員会　編」90-94.朝倉出版．東京．
• 25）小池伸介（2021）大型哺乳類．「森林学の百科事典　日本森林学会　編」136-137.丸善出版．東京．
• 24）Kozakai C, Seryodkin U, Pigeon EK, Yamazaki K, Wangchuk S, Koike S, Tsubota T, Jamtsho Y（2021） Asiatic Black Bear (Ursus thibetanus). In: Bears of the world. 110-121. Cambridge University Press．
• 23）Steyaert S, Zedrosser A, Swaisgood RR, Filipczykova E, Crudge B, Dutta T, Sharma S, Ratnayeke S, Koike S, Leclerc M, Derocher EA, Clapham M, Spady T, McLellan B, Ordiz A, Ferna´ndez-Gil A, Delibes M, Swenson EJ（2021）Mating strategies. In: Bears of the world. 21-35. Cambridge University Press.
• 22）小池伸介・長沼知子（2020）府中市の哺乳類の生息状況とその変遷．府中市．86-91．
• 21）小池伸介・沖和人（2020）府中市の昆虫類の生息状況とその変遷．府中市．74-85．
• 20）小池伸介（2020）ツキノワグマのすべて：森と生きる。．文一総合出版．東京
• 19）小池伸介（2019）冬眠中の出産！　身を削っての子育て―ツキノワグマ．「正解は一つじゃない　子育てする動物たち　齋藤慈子・平岩界・久世濃子　編」pp245-258．東京大学出版会．東京
• 18）小池伸介（2019）森林と動物、そして人間をめぐる関係．「森林と野生動物　小池伸介・山浦悠一・滝久智　編著」pp1-13．共立出版．東京
• 17）小池伸介（2019）ツキノワグマ．「森林と野生動物　小池伸介・山浦悠一・滝久智　編著」pp106-135．共立出版．東京
• 16）小池伸介（2018）ツキノワグマ－温帯アジアのメガファウナ－．「日本の食肉目　増田隆一　編」200－221．東京大学出版会．東京．
• 15）小池伸介（2017）わたしのクマ研究．127pp．さ・え・ら書房．
• 14）小池伸介（2017）生息環境の評価．「大型陸上哺乳類の調査法　小池伸介・山﨑晃司・梶光一　編著」119-137．共立出版．
• 13）小池伸介（2017）食性にかかわる調査．「大型陸上哺乳類の調査法　小池伸介・山﨑晃司・梶光一　編著」95-118．共立出版．
• 12）小池伸介 監修（2016）クマ大図鑑　体のひみつから人とのかかわりまで．63pp．PHP研究所．
• 11）小池伸介（2016）足尾・日光地域での12年間の調査から見えてきたクマの姿．「とちぎの野生動物　私たちの研究のカタチ　関義和・丸山哲也・奥田圭・竹内正彦　編著」pp42-51．随想舎．宇都宮．
• 10）梶光一・小池伸介（2015）日本モデルの構築に向けて．「野生動物管理システム　クマ・シカ・イノシシとの共存をめざして　梶光一・小池伸介　編」pp203-211．講談社．東京．
• 9）梶光一・小池伸介（2015）野生動物管理専門官の育成．「野生動物管理システム　クマ・シカ・イノシシとの共存をめざして　梶光一・小池伸介　編」pp178-184．講談社．東京．
• 8）小池伸介（2015）ツキノワグマ．「野生動物管理のためのフィールド調査法　関義和・江成広斗・小寺祐二・辻大和　編」pp87-97．京都大学学術出版会．京都．
• 7）小池伸介（2014）北米とスカンジナビアの野生動物管理．「野生動物管理システム　梶光一・土屋俊幸　編」pp177-198．東京大学出版会．東京．
• 6）小池伸介（2014）森林と動物．「教養としての森林学　井出雄二・大河内勇・井上真　編」．pp37-41．文永堂出版．東京．
• 5）小池伸介 (2013) クマが樹に登ると―クマからはじまる森のつながり　フィールドの生物学12巻．244p．東海大学出版会．
• 4）吉田剛司・小池伸介 (2013) アメリカ合衆国の狩猟．「野生動物管理のための狩猟学　梶光一・伊吾田宏正・鈴木正嗣　編」．Pp51‐60．朝倉書店、東京．
• 3）Koike S, Morimoto H, Kasai S, Goto Y, Kozakai C, Arimoto I, Yamazaki K (2012) Relationships between the fruiting phenology of Prunus jamasakura and timing of visits by mammals ? estimation of the feeding period using camera traps. In: Phenology and Climate Change, Xiaoyang Zhang ed., pp53-68, InTech publisher, 320p, Rijeka, Croatia
• 2）小池伸介 (2011) 食性と生息環境　特に果実の利用に注目して．「日本のクマ　ヒグマとツキノワグマの生物学　坪田敏男・山﨑晃司　編」．pp155-181．東京大学出版会．東京．
• 1）小池伸介（2011）種子散布者としてのツキノワグマが果たす生態系における役割．「ツキノワグマの生態学　山岳科学ブックレット　Vol.8.　信州大学山岳科学研究所　編」．Pp12‐39．オフィスエム．松本．

その他

• 67. 小池伸介（2024）私が動物散布の研究を始めたきっかけ．ブンイチ　2024年10月7日．⇒
• 66. 小池伸介（2024）「種子散布」の研究は、25年でこんなに変わった！ ブンイチ　2024年9月16日．⇒
• 65. 小池伸介（2024）最新の研究から見えてきたツキノワグマの姿．農業　1720：21-30
• 64. 小池伸介（2024）クマ棚・爪痕・樹皮はぎを見極める｜山の痕跡から分かる生態．YAMAP MAGAGINE　2024年4月8日.⇒
• 63. 小池伸介（2024）クマのウンチで山での暮らしと居場所を知る｜登山道のフィールドサイン．YAMAP MAGAGINE　2024年3月14日.⇒
• 62. 小池伸介（2024）なぜ、クマは森から出たのか？背景と今後の対策は．森林と林業　2024年1月号：8-9．
• 61. 小池伸介（2023）クマ被害　背景と今後の対策は．NHK　視点論点　2023年11月20日放送．⇒
• 60. 小池伸介（2023）各地で相次ぐクマの出没．視点　全国商工新聞　2023年11月20日．
• 59. 伊藤泰幹・稲垣亜希乃・小池伸介（2023）クマの市街地出没の現状と対策．街に出るクマ～アーバンベアとどう付き合うか～報告書．5-30．日本クマネットワーク．163p．札幌．
• 58. 小池伸介 (2023) アーバンベアプロジェクト３年間を振り返って．Bears Japan 23(3): 13.
• 57. 小池伸介 (2023) クマは何を見ている？．日本バイオロギング研究会会報　198：9-10．
• 56. 小池伸介（2022）なぜ、送電線の下にはチョウが多く見られるのか．日本昆虫協会ニュースレター　81: 12-14．
• 55. 小池伸介（2021）書評　ヒグマ学への招待　自然と文化で考える．哺乳類科学　61: 101-102．
• 54. 小池伸介（2021）クマに何が起きているのか？そして、クマはどのような動物なのか？　登山時報　553：6-17 >
• 53. 小池伸介（2020）クマを森から出さないためにやるべきこと．朝日新聞　WEB論座　2020年10月30日．
• 52. 小池伸介（2020）ツキノワグマの暮らし場所　人との距離が近くなっている？．望星9月号： 33-40．
• 51. 小池伸介・山田孝樹（2020）四国のツキノワグマの現状のまとめ．四国のツキノワグマを守れ！-50年後に100頭プロジェクト?報告書．23-25.日本クマネットワーク126p．札幌．
• 50. 小池伸介・山田孝樹・安藤喬平（2020）四国のツキノワグマの現状を知るための現地調査．四国のツキノワグマを守れ！-50年後に100頭プロジェクト?報告書．11-22.日本クマネットワーク126p．札幌．
• 49. 小池伸介（2020）ツキノワグマの「食」に迫る．どうぶつと動物園　718：12-17.
• 48. 小池伸介 (2020) 四国のツキノワグマの新たな生息地を探して．Bears Japan 20(3): 4.
• 47. 小池伸介 (2019) 捕まえたクマをどうしてる？．Bears Japan 20(1): 29-30.
• 46. 小池伸介 (2019) クマを調べるー食べ物・行動・分布編．Bears Japan 19(1): 5-6.
• 45. 小池伸介（2019）高い記憶力を持つツキノワグマ．山と渓谷　2019年9月号：60.
• 44. 稲垣亜希乃・三瀬友美子・ 山﨑晃司・ 小池伸介（2019）フィールドミュージアム多摩丘陵におけるホンドタヌキの行動圏とため糞場との関係．フィールドサイエンス 17：9-12
• 43. 小池伸介・山﨑晃司（2019）森に生きるツキノワグマのナビゲーション　－クマは渡りをするのか．生物の科学　遺伝 73: 182－186.
• 42. 小池伸介・飯田泰地（2018）ニホンジカの過増加により劣化した森林生態系の保全・再生に向けた基礎的研究．自然保護助成基金成果報告書 26：109-122
• 41. 加藤大貴・小池伸介（2018）フィールドミュージアム多摩丘陵における鳥類相とその特徴．フィールドサイエンス 16：9-13．
• 40. 長沼知子・横手里美・宮田桂子・小島善則・小坂井千夏・中島亜美・山﨑晃司・小池伸介（2017）ツキノワグマの冬眠行動研究における首輪内蔵型温度センサーの有効性の検討．フィールドサイエンス 15：41-47．
• 39. 小池伸介（2017）教えて　日本のクマ事情．自然保護 557：3-11.
• 38. 小池伸介（2017）クマ、人、森のつながりから学ぶ．教科研究　理科　205：10-15.⇒
• 37. 小池伸介（2016）山でクマに出会わないために．山と渓谷　2016年11月号：148－151．
• 36. 小池伸介・曽我昌史・飯田泰地（2016）国後島南部と知床岬で採取された地表性甲虫類および食糞性コガネムシ類とその比較．知床博物館研究報告　38: 5-12．⇒
• 35. Koike S, Yamazaki K, Sato Y (2015) Presentations related to bear management at the 5th International Wildlife Management Congress in Sapporo, Japan. International Bear News 24(3): 41-42.
• 34. 小池伸介（2015）森の生態系保つクマの役割．時標　山梨日日新聞　2015年1月18日　朝刊．
• 33. 小池伸介 (2014) 森林の分断化に伴う生物種の絶滅リスク評価及び優先保護地域の抽出：多摩丘陵における複数の種群・スケールの生物多様性を対象とした複合研究．公益財団法人とうきゅう環境財団　一般研究助成報告書312　83p，東京．
• 32. 小池伸介 (2014) 土地利用の歴史から九州のツキノワグマの生息状況を推定する．ツキノワグマおよびヒグマの分布域拡縮の現状把握と軋轢抑止および危機個体群回復のための支援事業報告書．146-147．日本クマネットワーク172p．茨城．
• 31. 小池伸介 (2013) ツキノワグマの長期研究とこれからの姿－採食生態を中心にして－．哺乳類科学 53：369-371.
• 30. 小池伸介 (2013) クマの冬眠場所はどこ？信州ツキノワグマ通信 60：14－15.
• 29. 小池伸介・池田敬・根本唯（2013）企画集会「哺乳類学への誘い－長期研究の中から見つかる面白さ－」を企画して.哺乳類科学 53: 215-223.
• 28. 小池伸介・山﨑晃司（2013）ツキノワグマの採食生態を読み解くカギ―多様なアプローチからわかること―．哺乳類科学 53: 161-163.
• 27. 小池伸介（2013）日本における食肉目の果実食の実態と結実フェノロジーとの関係．フェノロジー研究 48: 23-29.
• 26. Soga, M., Yamaura, Y., Koike, S (2013) From ecological pessimism to conservation chance: reviving living dead in changing landscapes. Animal Conservation 16: 16-18.
• 25. Yamazaki K, Nakajima A, Koike S (2012) Radioactive contamination of Japanese black bears by the Fukushima nuclear power plant explosion.International Bear News 21(1): 22-23.
• 24. 小池伸介 (2011) 虫類を指標とした都市近郊の里山の生物多様性評価手法に関する研究. Green Letter 33: 31.
• 23. 小池伸介 (2011) ミネソタ州のアメリカクロクマ調査に参加して．Bears Japan 12(1): 10-11．
• 22. 小池伸介 (2011) ツキノワグマと生物多様性をつなぐ研究を目指して．Bears Japan 11(3): 67-68．
• 21. 曽我昌史・小池伸介 (2011) フィールドミュージアム多摩丘陵および周辺におけるオサムシ科甲虫類相とその特徴.フィールドサイエンス 9 : 59-64.
• 20. 曽我昌史・小池伸介 (2011) フィールドミュージアム多摩丘陵における蝶類相とその特徴.フィールドサイエンス 9 : 53-58.
• 19. 山﨑晃司・小池伸介・丸山哲也・橋本幸彦（2011）関東地方でのツキノワグマによる人身事故の概要と特徴．人身事故情報に関する報告書． 56-77．日本クマネットワーク．145p．藤沢．
• 18. 山﨑晃司・小池伸介 (2011)ツキノワグマの土地利用は食物資源の変化にどのように対応しているのか？. 哺乳類科学 51: 159-162．
• 17. 斎藤正恵・小池伸介・梶光一 (2011) ｢統合的な野生動物管理システムの構築｣へ向けて．哺乳類科学 51：197-200．
• 16. 小池伸介 (2011) ツキノワグマと生物多様性をつなぐ研究を目指して．Bears Japan 11(3)：67-68．
• 15. 斎藤正恵・小池伸介・梶光一 (2011) ｢統合的な野生動物管理システムの構築｣へ向けて．ワイルドライフフォーラム 15(2)：38-39．
• 14. Yumoto K, Yamazaki K, Koike S, Kozakai C, Nemoto Y, Nakajima A (2010) Ixodid Ticks Collected from Japanese Black Bears in the Northern Kanto District, Central Japan (Arachnida, Acarina). Bulletin of Ibaraki Nature Museum 13：81-84．
• 13. 小池伸介 (2010) 生物多様性とツキノワグマをつなぐ研究．山岳科学総合研究所ニュースレター 24号：2．
• 12. 小池伸介 (2010) ヤマザクラ．日本緑化工学会誌 35：482．
• 11. 山﨑晃司・Hwang Mei-Hsiu・小池伸介 (2010) 東アジアでの哺乳類保全の現状と課題－地域との合意形成と協働－. 哺乳類科学 50: 81-86．
• 10. 山﨑晃司・小池伸介 (2009) 出没をめぐるツキノワグマの生態. 森林科学 57：4-8．
• 9. 山﨑晃司・小池伸介・小坂井千夏・根本唯・中島亜美 (2009) ツキノワグマの土地利用と出没に関する研究－これまでの背景と、どこまでわかってきたのか－. 哺乳類科学 49：169-172．
• 8. Nakajima A, Koike S, Masaki T, Shimada T, Yamazaki K, Kaji K (2009) Altitudinal change in the fruiting phenology of deciduous oak in relation to feeding behavior of the Asiatic black bear. Biology of Bear Intrusions 72-75．
• 7. Koike S, Kozakai C, Nakajima A, Nemoto Y, Yamazaki K (2009) Influence of fruiting phenology on fruit feeding behavior of Asiatic black bear, central Japan. Biology of Bear Intrusions 67-71．
• 6. Kozakai C, Yamazaki K, Nemoto Y, Nakajima A, Koike S, Kaji K (2009) Behavioural study of free-ranging Japanese black bears II - How does bear manage in a year of food shortage? Biology of Bear Intrusions 64-66．
• 5. Yamazaki K, Koike S, Kozakai C, Nemoto Y, Nakajima A (2009) Behavioural study of free-ranging Japanese black bears I - Does food abundance affect the habitat use of bears? Biology of Bear Intrusions 60-63．
• 4. 小池伸介 (2008) ツキノワグマは成熟した果実を食べているのか？．Bears Japan 9(1):17-18．
• 3. 高槻成紀・塚田英晴・辻大和・小池伸介 (2008) 哺乳類の食べ物：食性研究の「次の一手」. 哺乳類科学 48: 189-197．
• 2. 小池伸介 (2008) クマは森を育てている？～クマと果実の甘い関係～．茨城県自然博物館　第43回企画展「熊－森のアンブレラ種－」図録．24-25．
• 1. 小池伸介 (2008) ツキノワグマは森で何を食べている？．24-25．立山砂防カルデラ博物館　第19回企画展　立山カルデラの生き物たち「ツキノワグマの鼓動」図録． 47p．立山カルデラ砂防博物館．富山．

学位論文

卒業論文

• 牧野珠子（2024）「渡り」を行う単独性の陸上大型哺乳類における秋の長距離移動時の行動特性．
• 安田和真（2024）ニホンジカが高密度に生息する地域における植生保護柵内で記録された鳥類群集構造に影響する環境条件の検討．
• 吉竹　歩（2024）Calculating the values that identifies inactivity from activity sensors in GPS collars on wild Japanese serow．
• 小堀　源（2023）植生保護柵およびその配置条件の違いが柵内の甲虫群集構造に与える影響．
• 蜂矢　愛（2023）双翅目幼虫による大型脊椎動物死体分解にかかわる要因の評価．
• 佐藤華音（2022）付着散布における植物種と散布動物種の種間関係．（論文111, 121に掲載）
• 田中美衣（2022）針葉樹人工林におけるアリ類の営巣する切株の条件．（論文110に掲載）
• 手塚詩織（2022）大型果実食動物による垂直方向の潜在的な種子散布範囲の推定．
• 島崎　斐（2021）景観構造がツキノワグマの移動に与える影響の検証．
• 前田七海（2021）低山帯の暖温帯林におけるニホンカモシカの食性の植生構造との関係． （論文119に掲載）
• 郷　朝紀（2020）カメラ付き首輪を用いたオスのツキノワグマの繁殖期の行動解明の試み． （論文92に掲載）
• 三宮　望（2020）Lidarを用いて定量化した森林垂直構造とコウモリ類各種の生息状況の関係．
• 沖 和人（2019）人工林地帯におけるチョウ類生息環境としての送電線敷の評価．（論文95に掲載）
• 高山 楓（2019）遺伝情報を用いたツキノワグマの分散距離及び分散開始年齢の推定と分散距離への影響要因の検証．（論文107に掲載）
• 久保田将海(2019）東京都平野部におけるチョウ相の変化と景観変化の関係．（書籍21に掲載）
• 栃木香帆子（2018）Impact of beechnut (Fagus crenata) masting on reproductive success of Asiatic black bear (Ursus thibetanus)．（論文67に掲載）
• 比留間光子（2018）ニホンカモシカの冬期における食性の長期的変化とその要因～個体群動態への影響～．（論文102に掲載）
• 稲垣亜希乃（2017）二ホンジカ(Cervus nippon)遺体の消失における脊椎動物種の役割の評価．（論文79, 104に掲載）
• 山 隼人（2017）シカの過採食が鱗翅目の形質変化に及ぼす影響の可能性についての検討． （論文72に掲載）
• 岩崎 正（2016）ツキノワグマの冬眠及び冬眠前行動の開始要因の検討 ． （論文94に掲載）
• 大杉 滋（2016）落下した果実の中大型哺乳類による持ち去り行動の定量的評価．（論文73に掲載）
• 加藤大貴（2016）鳥類各種による種子散布環境の推定と散布貢献度の評価．（論文60に掲載）
• 飯田泰地（2015）シカの過増加が引き起こす昆虫群集の改変：複数分類群を用いた比較検証．（論文49に掲載）
• 小橋川祥子（2015）クマの樹皮剥ぎ行動の発生に及ぼす要因の時空間的比較・検討． （論文52に掲載）
• 新倉夏美（2014）針葉樹人工林によって断片化された広葉樹林での鳥類の生息地選択に影響を与える要因．（論文57に掲載）
• 三瀬友美子（2014）哺乳類における被食散布型種子の距離算出法の比較． （論文54、その他44に掲載）
• 古坂志乃（2014）直接観察法によるツキノワグマの春の採食行動と採食物の栄養価の関係．（論文58に掲載）
• 横手里美 (2011) ツキノワグマの冬眠行動解析におけるＧＰＳ首輪に内蔵された温度センサーの有用性の検討．（その他40に掲載）
• 菅野 希 (2011) 都市近郊の森林環境が地表性甲虫類の生息状況に与える影響．（論文27に掲載）
• 藤津亜希子 (2010) 樹木特性が鳥類の果実の採食行動に与える影響．（論文46に掲載）
• 曽我昌史 (2010) 都市近郊における蝶類に林分レベルの要因が及ぼす影響．（論文19，18，34に掲載）

修士論文

• 佐藤華音（2024）有蹄類による付着種子散布：ヌタ場およびこすり木周辺への散布可能性の定量的な評価．
• 島崎　斐（2023）Hidden Markov Modelを用いた単独性大型食肉目の休息場所の環境条件の評価．
• Baek Seungyun（2022）What factors affect the distribution expansion of large mammals in central and southern parts of Japan?．
• 沖 和人（2021）スキー場の放棄はチョウ類の多様性を低下させる．（論文101に掲載）
• 高山 楓（2021）ツキノワグマの成長パターンと繁殖成功に対する食物資源量の影響の検証．
• 栃木香帆子（2020）Does phenological shift along elevations facilitate vertical dispersal of pollen and seeds at a distributional range border of two interfertile wild cherry species?．（論文89に掲載）
• 比留間光子（2020）高山帯および亜高山帯におけるニホンジカとニホンカモシカの食性と食性重複に植生が及ぼす影響． （論文109に掲載）
• 稲垣亜希乃（2019）雑食性哺乳類による有蹄類死体のスカベンジングメカニズムの評価． （論文114に掲載）
• 山 隼人（2019）二ホンジカ(cervus nippon)の生息密度の違いが食糞性コガネムシの幼虫の食性に及ぼす影響について．（論文77に掲載）
• 大杉　滋（2018）ヤマザクラ樹冠下での哺乳類の果実採食行動における共存メカニズムの検討．（論文73に掲載）
• 加藤大貴（2018）The evaluation of the role of woodpeckers for forest regeneration in the fragmented broad-leaved forest by the coniferous plantation．
• 岩崎　正（2018）気温変化に対するツキノワグマの環境と活動状態選択の変化．
• 名生啓晃（2018）ツキノワグマの行動内容別の生息地選択．
• 飯田泰地（2017）The overabundance of sika deer (Cervus nippon) affects forest ecosystem function by altering the structure of dung beetle communities．（論文61に掲載）
• 小橋川祥子（2017）クマ剥ぎへの資材防除の実施が周辺林分でのクマ剥ぎ発生率に及ぼす影響．（論文71に掲載）
• 安藤喬平（2017）Movement patterns of large solitary carnivore in fluctuating environment varies with environmental and individual factors.（論文100に掲載）
• 青木薫乃（2017）ツキノワグマの歯のセメント質年輪幅の決定要因の検討．（論文69に掲載）
• 古坂志乃 (2016) ツキノワグマのエネルギー収支とタンパク質摂取の季節変化の推定．（論文75に掲載）
• 藤津亜希子 (2012) 低木における鳥類の種子散布者としての可能性および低木の種子散布戦略の検討.
• 曽我昌史 (2012) Time-lag between landscape change and biodversity loss: an evidence of extinction debt.（論文28に掲載）

博士論文

• 長沼知子（2020）ツキノワグマの個体群内の食性の多様度に及ぼす学習の影響．（日本学術振興会特別研究員 DC1）（論文85, 99に掲載）
• 大杉　滋（2021）都市近郊林におけるタヌキの種子散布者としての役割の評価．（論文78, 97に掲載）
• 栃木香帆子（2023）Impact of masting of Fagaceae hard mast on population dynamics of Asian black bear．（日本学術振興会特別研究員 DC1）（論文113に掲載）
• 稲垣亜希乃（2024）Vertebrate scavenging on deer carcasses in a temperate forest ecosystem．（日本学術振興会特別研究員 DC1）

主な表彰

• Baek Seungyun・Zedrosser Andreas・山﨑晃司・小池伸介（2024）ツキノワグマによる断片化された景観におけるリスクテイク行動の季節間の違いの評価」．日本哺乳類学会　2024年優秀発表賞
• 栃木香保子 (2024) 日本森林学会学生奨励賞 2024 "Differentiation and seasonality in suitable microsites of seed dispersal by an assemblage of omnivorous mammals."
• Koike S, Tochigi K, Yamazaki K (2024) Journal of Forest Research Award 2024 "Are seeds of trees with higher fruit production dispersed farther by frugivorous mammals?."
• Network structure of vertebrate scavenger assemblages at the global scale: drivers and ecosystem functioning implications. John Wiley & Sons『Top Downloaded Article 2021』 in Ecology．
• 
  
• Phenological shift along an elevational gradient and dispersal of pollen and seeds maintain a hybrid zone between two cherry tree species. John Wiley & Sons『Top Downloaded Article 2021』 in Plant Species Biology．
• 
  
• Animal-borne video systems provide insight into the reproductive behavior of the Asian black bear. John Wiley & Sons『Top Downloaded Article 2021』 in Ecology and Evolution．
• 
  
• Naganuma T, Koike S, Nakashita R, Kozakai C, Yamazaki K, Furusaka S, Kaji K 　Mammal Study論文賞．
• Masaki T, Abe S, Naoe S, Koike S, Nakajima A, Nemoto Y, Yamazaki K (2021) Journal of Forest Research Award 2021 "Horizontal and elevational patterns of masting across multiple species in a steep montane landscape from the perspective of forest mammal management."
• 栃木香保子 (2019) 東京農工大学大学院農学府　学術研究賞．
• 稲垣亜希乃 (2019) 東京農工大学大学院農学府　学術研究賞．
• 栃木香帆子・玉谷宏夫・小坂井千夏・稲垣亜希乃・長沼知子・名生啓晃・山﨑晃司・小池伸介（2018）ツキノワグマの歯の年輪幅への繁殖履歴の反映の解明．日本哺乳類学会　2018年　口頭発表賞．
• 稲垣亜希乃・丸山哲也・山﨑晃司・小池伸介（2018）死体を食べない？食べられない？シカ死体をめぐる中・大型哺乳類のスカベンジング行動の仕組み．日本哺乳類学会　2018年優秀ポスター賞．
• Kozakai C, Koike S, Ohnishi N, Yamazaki K 　Mammal Study論文賞．
• 稲垣亜希乃 (2018) 東京農工大学大学院農学府　学術研究賞．
• 稲垣亜希乃・丸山哲也・山﨑晃司・小池伸介（2017）ニホンジカ死体消失における脊椎動物の役割の評価．日本哺乳類学会　2017年　口頭発表賞．
• 稲垣亜希乃 (2017) 東京農工大学農学部地域生体システム学科　優秀卒業論文賞．．
• 加藤大貴 (2016) 第51回東京都公園協会賞　奨励賞．
• 小橋川祥子 (2016) 東京農工大学大学院農学府　学術研究賞．
• 小橋川祥子（2015）平成27年学生森林技術研究論文コンテスト　日本森林技術協会理事長賞．
• 小池伸介（2015）第19回日本生態学会宮地賞．
• 
  Ecological Researchの表紙写真の１枚に足尾のクマの写真（撮影：横田博）が採用されました。
• 小池伸介（2014）第3回いきものにぎわい市民活動大賞　富士フイルム・グリーンファンド活動奨励賞．　
• 小池伸介（2013）第12回日本農学進歩賞.　
• 小池伸介（2013）第11回日本哺乳類学会奨励賞.　
• 曽我昌史・小池伸介・山浦悠一 (2013) 成立時期の異なる樹林地間での群集比較：チョウ類、オサムシ科甲虫類を用いた検証．第124回日本森林学会 優秀ポスター賞．
• Enari H, Koike S, Sakamaki H (2013) Journal of Forest Research Award 2013 "Diversity of dung beetle assemblages utilizing Japanese monkey feces in cool-temperate forests: influence of seasonality and forest disturbance."
• Nakajima A, Koike S, Masaki T, Sugita A, Yamazaki K, Kaji K (2012) Seasonal change in foraging strategy of Asian black bears revealed by ecological and physiological factors. 21th International Association for Bear Research and Management. Best Poster Presentation．
• 曽我昌史・小池伸介 (2012) 急速な都市化とタイムラグを伴う蝶類の衰退: Extinction debtの検証．2011年度日本森林学会　ポスター賞．
• 小池伸介 (2012) 平成24年日本森林学会奨励賞.
• Soga M, Koike S (2012) Time-lag between landscape change and biodiversity loss: an evidence of extinction debt. The 5th EAFES International Congress. The best poster award
• 曽我昌史 (2011) 東京農工大学大学院農学府　学術研究賞．
• 梅村佳寛・小坂井千夏・中島亜美・根本唯・小池伸介・郡麻里・阿部真・正木隆・山崎晃司・梶光一 (2011) ブナ科堅果資源量の年次変化がツキノワグマの生息地選択に与える影響　2010年度日本生態学会　最優秀ポスター賞．
• 小坂井千夏・山崎晃司・根本唯・中島亜美・小池伸介・梶光一・阿部真・正木隆 (2011) ツキノワグマの活動量はtemporal に変動する　―堅果結実量が異なる年次間の共通点と相違点―．2010年度日本生態学会　優秀ポスター賞．
• 小池伸介 (2010) 2010年度信州フィールド科学賞．
• 江成広斗・小池伸介・坂牧はるか (2010) 冷温帯林におけるニホンザルの糞を利用する食糞性コガネムシの多様性と生息分布．第16回野生生物保護学会・日本哺乳類学会2010年度合同大会　最優秀ポスター賞．
• 曽我昌史・小池伸介 (2010) 都市近郊林の蝶類に林分レベルの要因が及ぼす影響．2009年度日本生態学会　優秀ポスター賞．
• 小坂井千夏・山﨑晃司・根本唯・中島亜美・小池伸介・梶光一 (2009) ツキノワグマは食物不足の秋をどう乗り切るのか？．2009年度日本哺乳類学会　優秀ポスター賞．