GENOME AND METABOLIC PATHWAYS / ゲノムおよび代謝経路の解明


In our group we constantly perform isolation of bacterial strains from various environmental settings with the main goal to discover novel strains and elucidate their genetic and metabolic characteristics. Here, we report novel strains that have been discovered from our collection efforts.
 
私達のグループでは、研究室に配属された学生のトレーニングの一環として、環境中からの微生物の単離を積極的に行っています。単離した微生物中、私達は新奇・希少な微生物に着目し、これらの新奇微生物の遺伝的バックグラウンドやその代謝経路の解明研究も行っています。


RESEARCH HIGHLIGHTS / 研究成果


PUBLICATION: Zulmajdi AA et al., Microbial. Resour. Announc. DOI: 10.1128/mra.00437-22 (2022)

 
SUMMARY: We report the draft genome of a bacterial strain, Kangiella sp. strain TOML190 isolated from the surface of a striped shore crab. Genetic background analysis of this strain shows that it harbors unique features possibly related to its symbiotic adaptation to its residing host.
 
私達のグループでは、イワガニの表面から初めてKangiella属に属する細菌、Kangiella sp. TOML190の単離に成功した。ゲノム解析により、TOML190株はイワガニと共生している可能性が示唆された。
PUBLICATION: Mori T et al., Genome Announc. 2(4) (2014)

COLLABORATORS: Ueda Lab, Kyoto University; Shibata Lab, Mie University; Tanaka Lab, Mie University; Takeyama Lab, Waseda University
 
SUMMARY: We report the draft genome of a novel alginate-degrading bacterium, Falsirhodobacter sp. strain alg1. We found that this strain harbors unique and extremely efficient alginate lyases making it evolutionary distinct from currently discovered alginate-degrading bacteria.
 
私達のグループでは、現在報告されたアルギン酸分解細菌と遺伝的に離れた新奇細菌種、Falsirhodobacter sp. strain alg1の単離に成功した。本論文では、この細菌のドラフトゲノムを報告した。