- 平成19年度日本植物病理学会学会賞 寺岡 徹 「イネ・いもち病菌の相互認識機構に関する研究」2007年3月
- 平成19年度日本植物病理学会論文賞 H, Takahashi, A. Shimizu, T. Arie , S. Rosmalawati , S. Fukushima , M. Kikuchi , Y. Hikichi, A. Kanda, A. Takahashi, A. Kiba, K. Ohnishi, Y. Ichinose, F. Taguchi, C. Yasuda, M. Kodama, M. Egusa, C. Masuta, H. Sawada, D. Shibata, K. Hori and Y. Watanabe (2006) PCR-based differentiation of Fusarium oxysporum ff. sp. lycopersici and radicis-lycopersici and races of F. oxysporum f. sp. lycopersici J. Gen. Plant Pathol.:71 (1):8-22 (2005)（共同研究内容） 2007年３月
- 平成19年度日本農学会賞・読売農学賞 米山勝美（本研究室卒業生） 「植物病原菌の病原因子の解明と病害抵抗性植物の創成に関する先駆的研究」 2007年4月
- 平成20年度日本植物病理学会論文賞 Yasushi Hirano, Tsutomu Arie (2006) PCR-based differentiation of Fusarium oxysporum ff. sp. lycopersici and radicis-lycopersici and races of F. oxysporum f. sp. lycopersici JGPP 72: 273-283 (2006) （共同研究内容） 2008年3月
- 土壌微生物学会２００８年度大会最優秀ポスター賞 稲見圭悟・川部眞登・岡部明子・石川暢子・Tobin L. Peever・児玉基一朗・寺岡 徹・有江 力 「トマト属植物（Lycopersicon spp.）組織および根圏土壌から分離されるFusarium oxysporumの分子系統解析」 2008年6月
- 日本植物病理学会平成２１年度大会学生優秀発表賞 加藤亮宏「Talaromyces sp. KNB-422によるイネばか苗病生物防除メカニズムの解析」 2009年4月
- 日本植物病理学会平成２１年度大会学生優秀発表賞 青木菜々子 「Alternaria alternara mycovirus 1のウイルス様粒子を構成するタンパク質の生化学的解析（共同研究内容）」 2009年4月
- 第９回糸状菌分子生物学コンファレンス優秀ポスター発表賞 稲見圭悟 「トランスポゾン挿入によるトマト萎凋病菌の非病原力遺伝子の機能喪失」 2009年11月
- 平成22年度日本植物病理学会学会賞 有江 力 「土壌伝染性フザリウム菌の発病機構と分子系統解析に関する研究」2010年4月
- 平成22年度日本植物病理学会学奨励賞 斎藤憲一郎（本研究室卒業生） 「イネいもち病菌の付着器形成に関わる分子生物学的研究」2010年4月
- 平成22年度日本農薬学会論文賞 Takanobu Yoshida, Masato Kawabe, Yuichiro Miyata, Tohru Teraoka, Tsutomu Arie(2008) Biocontrol activity in a nonpathogenic REMI mutant of Fusarium oxysporum f. sp. conglutinans and characterization of its disrupted gene. J Pestic Sci 33(3):234-242 Abstract 2010年5月
- 日本植物病理学会平成２２年度大会学生優秀発表賞 稲見圭悟 「トマト萎凋病菌新型レース３では非病原力遺伝子SIX4がトランスポゾンによって破壊されていた」 2010年4月
- 日本植物病理学会平成２２年度大会学生優秀発表賞 柏 毅 「キャベツ萎黄病菌はトマト萎凋病菌レース1の非病原力遺伝子SIX4 を保持する」 2010年4月
- 日本植物病理学会平成２２年度大会学生優秀発表賞 荒添貴之 「ストレスおよび感染過程において誘導されるイネいもち病菌の体細胞相同組換え」 2010年4月
- 土壌微生物学会２０１０年度大会最優秀ポスター賞 稲見圭悟ら 「 トマト萎凋病菌の新型レース３の発生について」 2010年5月
- 土壌微生物学会２０１０年度大会優秀ポスター賞 柏 毅ら 「キャベツ萎黄病菌はトマト萎凋病菌レース１に特有の非病原力遺伝子ホモログを保持する」 2010年5月
- 土壌微生物学会２０１２年度大会最優秀ポスター賞 柏 毅ら 「 遺伝子破壊によるキャベツ萎黄病菌SIX4の機能解析」 2012年6月