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住所とアクセス

184-0012 東京都小金井市中町 2-24-16
東京農工大学 小金井キャンパス

東京駅からJR中央線で東小金井駅まで約40分
東小金井駅から研究室まで徒歩約15分; 部屋は5号館3階301(南),302

学生の声

学生の声へのリンク
学生の声へのリンク(2010年度版)

関連する主なプロジェクト

"多元計算解剖学"

革新脳

ニュース

2017

  • 19-20 January
    IFMIA2017 を沖縄(那覇ぶんかテンブス館)で開催します.

2016

  • 1月14日
    斉藤君の博士論文の公聴会を以下の通り開催します.
    日時:2016年1月14日 14時45分〜
    場所:3号館210号室
    題目:統計的形状モデルに基づく腹部臓器セグメンテーション

2015

  • 11月〜
    3年生による清水(昭)研の見学を実施します. 研究活動内容については左のメニューから「研究紹介」を選んで読んでください.
  • 10月
    小畑・清水研合同のOB・OG会を開催しました.
    日立の荻野さんが社会人ドクターとして研究室に配属されました.
  • 4月
    新4年生5名が正式に配属されました.
  • 1月13日
    M2の大島君がIFMIA2015でBest Paper Awardを受賞しました.

2014

  • 11月〜12月
    3年生による清水(昭)研の見学を実施しました.
  • 9月
    小畑・清水研合同のOB・OG会を開催しました.
  • 7月
    新しいプロジェクト,多元計算解剖学が始まりました。
  • 4月
    新4年生5名が正式に配属されました.
    東大病院の医師(放射線科助教)の花岡先生が社会人ドクターとして研究室に配属されました.
  • 3月8-9日
    計算解剖学の成果報告会を東大の武田先端知ビルで開催しました.多数のご参加ありがとうございます。

2013

2012

2011

  • 12月
    キヤノンとの共同研究を開始しました.
  • 10月1日(土)
    小畑・清水研合同のOB・OG会を開催しました.
  • 7月17日(日)
    小畑先生の最終講義と退職記念祝賀会を開催しました.沢山の方にご参加を頂きました.ありがとうございました.
    最終講義
    日時:平成23年7月17日(日曜日)14:00〜15:30
    場所:アルカディア市ヶ谷 3階 富士
       〒102-0073 東京都千代田区九段北 4-2-25
    演題:目と耳を持つ機械を目指した36年 ―鉄腕アトムに憧れて―
    退職記念祝賀会
    日時:平成23年7月17日(日曜日)16:00〜18:30
    会場:アルカディア市ヶ谷 3階 富士
       〒102-0073 東京都千代田区九段北 4-2-25

2011年3月22日(火曜日)に予定しておりました「小畑学長最終講義」は、東北地方太平洋沖地震発生に伴い、余震発生及び計画停電の実施により聴講者の安全確保が懸念されるため延期します。なお、延期後の開催日は、後日、ホームページ上でお知らせします。

-3月22日
小畑学長の最終講義(題目:人間的機械を目指した36年 ――鉄腕アトムに憧れて――)を開催します.時間は午後3時から,場所は小金井新一号館L0111です.
また,最終講義の懇親会を午後5時より生協1階食堂ホールで実施します.参加費は4000円で,当日受付いたします.
いずれも事前登録不要です
小金井キャンパスマップの14番が新一号館,19番が生協です.
なお,開催案内の送付は小畑・清水研OB会リストを元に行います.毎年開催しているOB会の案内が届いていない場合には,リストから漏れている可能性があります.清水(simiz(at)cc.tuat.ac.jp)まで連絡を下さい.

2010

2009

2008

Mission

Goal of the medical image analysis laboratory is the research, development and validation of image processing algorithms and computer-aided diagnosis systems that enable the objective and reproducible evaluation of anatomical and pathological structures in medical images.

Project

セグメンテーションアルゴリズム

  • 非造影上腹部CT像からの複数臓器同時抽出(12臓器)
    multiorgan.jpg
  • 膵臓(造影CT像)
    pancreas.gif
  • 肝臓腫瘤(造影CT像) 2008年の国際学会のアルゴリズムコンテストで優勝しました.>>ニュース
    lts.gif

CAD

  • PET and CT images.
  • Autopsy imaging.

Recent selected papers

日本語のページへのリンク

Address and access to our laboratory

2-24-16 Naka-cho, Koganei-shi, Tokyo 184-0012
Tokyo University of Agriculture and Techonology

Take the JR Chuo Line (rapid train) from Tokyo Station to Higashi-Koganei Station: about 40 minutes.
Walk about 15 minutes from Higashi-Koganei Station to our laboratory; Room 301(south) and 302 at 3rd floor of "5th bldg. at Koganei Campus"

Active major projects of MIA lab.

"Multidisciplinary Computational Anatomy"

"BRAIN/MINDS"

News

2017

  • 19-20 January
    IFMIA2017 will be held in Okinawa.

2016

  • 14 January
    PhD defense presentation by Mr. Atsushi Saito
    Date: 14th January, 14:45〜
    Place: Bldg.3 Room 210
    Title: Abdominal organ segmentation based on a statistical shape model

2015

  • 13 January
    Mr. Reito Oshima received a best paper award in IFMIA2015.

2014

  • 8,9 March
    The Final International Symposium on the Project "Computational Anatomy" was held at the University of Tokyo.

2013

  • 29 Nov. - 18 Dec.
    Laboratory tour for 3rd degree undergraduate students : No reservation is required
    Time : 14:45-18:00(Tuesday, Friday), 16:00-18:00(12/9,16)

2012

  • 17 Nov
    Mr. Shun Umetsu received a best poster award in IFMIA2012.

2011

  • Dec MIA lab. has started collaborative research with CANON.
  • 17 July
    The former president Kobatake gave a final lecture and a party was held.
  • 19 May
    Mr. Yuji Uchida who graduated from our lab. in this March was awarded the research encouraging prize (Kenkyu Syourei-sho in Japanese) from Medical Imaging Group of IEICE.

2010

  • 31 July
    Mr. Ippei Nomura who graduated from MIA lab. in this March was awarded the encouraging prize (Syourei-sho in Japanese) in JAMIT annual meeting.

2009

  • 4 August
    Mr. Takuya Narihira (M2) won in the competition of automatic liver tumor segmentation in JAMIT annual meeting 2009.
  • 21 January
    Mr. Takuya Narihira (M1) and Mr. Tatsuya Kimoto (M2) were awarded poster prizes simultaneously in IFMIA 2009.

2008

  • 14 October Post doctoral researcher Dr. Oost of Leiden Univ. Medical Center in the Netherlands has joined our laboratory.

Mission

Goal of the medical image analysis laboratory is the research, development and validation of image processing algorithms and computer-aided diagnosis systems that enable the objective and reproducible evaluation of anatomical and pathological structures in medical images.

Research topics

Jump to page of research topics

Gallery

Segmentation algorithms

  • Simultaneous segmentation of 12 organs in an upper abdominal non-contrast CT image.
    multiorgan.jpg
  • Pancreas segmentation from contrast enhanced CT images.
    pancreas.gif
  • Liver tumor segmentation from a contrast enhanced CT image [It won 1st prize in the international competition 2008. see "News"].
    lts.gif

Recent selected papers

1)Shouhei Hanaoka, Akinobu Shimizu, Mitsutaka Nemoto, Yukihiro Nomura, Soichiro Miki, Takeharu Yoshikawa, Naoto Hayashi, Kuni Ohtomo, Yoshitaka Masutani : Automatic detection of over 100 anatomical landmarks in medical CT images: a framework with independent detectors and combinatorial optimization, Medical Image Analysis, 2016
doi:10.1016/j.media.2016.04.001

2)Iwao Hasegawa , Akinobu Shimizu, Atsushi Saito, Hideto Suzuki, Hermann Vogel, Klaus Püschel, Axel Heinemann : Evaluation of post-mortem lateral cerebral ventricle changes using sequential scans during post-mortem computed tomography, International Journal of Legal Medicine, pp.1-6, 2016
doi:10.1007/s00414-016-1327-2

3)Atsushi Saito, Shigeru Nawano and Akinobu Shimizu : Joint optimization of segmentation and shape prior from level-set-based statistical shape model, and its application to the automated segmentation of abdominal organs, Medical Image Analysis, vol.28, pp.46-65, 2016
DOI: http://dx.doi.org/10.1016/j.media.2015.11.003

4)Shun Umetsu, Akinobu Shimizu, Hidefumi Watanabe, Hidefumi Kobatake, Shigeru Nawano : An automated Segmentation Algorithm for CT Volumes of Livers with Atypical Shapes and Large Pathological Lesions. IEICE TRANSACTIONS on INF. & SYST., vol.E97-D, no.4, pp.951-963, 2014
http://search.ieice.org/bin/summary.php?id=e97-d_4_951

5)Sho Tomoshige, Elco Oost, Akinobu Shimizu, Hidefumi Watanabe, Shigeru Nawano : A conditional statistical shape model with integrated error estimation of the conditions; application to liver segmentation in non-contrast CT images, Medical Image Analysis, vol.18, pp.130-143, 2014, DOI: http://dx.doi.org/10.1016/j.media.2013.10.003

6)Atsushi Saito, Akinobu Shimizu, Hidefumi Watanabe, Seiji Yamamoto, Shigeru Nawano and Hidefumi Kobatake : Statistical Shape Model of a Liver for Autopsy Imaging, International Journal of Computer Assisted Radiology and Surgery, 2013 http://dx.doi.org/10.1007/s11548-013-0923-6

7) Akinobu Shimizu, Takuya Narihira, Daisuke Furukawa, Hidefumi Kobatake, Shigeru Nawano and Kenji Shinozaki : Ensemble learning based segmentation of metastatic liver tumours in contrast-enhanced computed tomography.IEICE TRANSACTIONS on INF. & SYST., vol.E96-D, no.4, pp.864-868, 2013. http://search.ieice.org/bin/summary.php?id=e96-d_4_864

8)Keita Nakagomi, Akinobu Shimizu, Hidefumi Kobatake, Masahiro Yakami, Koji Fujimoto,Kaori Togashi : Multi-shape graph cuts with neighbor prior constraints and its application to lung segmentation from a chest CT volume, Medical Image Analysis, 17, pp.62-77, 2013 http://dx.doi.org/10.1016/j.media.2012.08.002

9)A. Shimizu, T. Kitasaka, S. Nawano, K. Shinozaki and Y. Tateno : 3D Medical Image Processing Algorithm Competition in Japan, Proc of International Forum on Medical Imaging in Asia (IFMIA) 2011, S1-2, 2011

>>PDF

10)Akinobu Shimizu, Tatsuya Kimoto, Hidefumi Kobatake, Shigeru Nawano, Kenji Shinozaki : Automated pancreas segmentation from three-dimensional contrast-enhanced computed tomography, International Journal of Computer Assisted Radiology and Surgery, 2009, DOI 10.1007/s11548-009-0384-0

>>PDF

11) Akinobu Shimizu, Takuya Narihira, Daisuke Furukawa, Hidefumi Kobatake, Shigeru Nawano and Kenji Shinozaki : Ensemble segmentation using AdaBoost? with application to liver lesion extraction from a CT volume, Proc. of workshop in MICCAI2008, 2008

12) Ludvik Tesar , Akinobu Shimizu, Daniel Smutek, Hidefumi Kobatak, Shigeru Nawano : Medical image analysis of 3D CT images based on extension of Haralick texture features, Computerized Medical Imaging and Graphics 32, pp.513–520, 2008

>>PDF

13) Akinobu Shimizu, Rena Ohno, Takaya Ikegami, Hidefumi Kobatake, Shigeru Nawano, Daniel Smutek : Segmentation of multiple organs in non-contrast 3D abdominal CT images, International Journal of Computer Assisted Radiology and Surgery , vol.2, no.3-4, pp.135-142, 2007

>>PDF

14) Cong Yao, Takashige Wada, Akinobu Shimizu, Hidefumi Kobatake, Shigeru Nawano : Probabilistic Atlas-guided Eigen-organ Method for Simultaneous Bounding Box Estimation of Multiple Organs in Volumetric CT Images, Medical Imaging Technology, Vol.24, No.3, 2006

>>PDF

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新学術領域研究:多元計算解剖学;
新学術領域研究:計算解剖学;
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Last-modified: 2011-09-05 (月) 09:32:27 (1729d)